Z dôvodu potreby výroby zbraní sa už v 15. storočí objavili hydraulicky poháňané sudové vyvrtávačky. Po získaní patentu na praktický parný stroj J. Wattom v roku 1769 sa presnosť opracovania valca stala kľúčovou otázkou pre parný stroj. V roku 1774 Angličan J. Wilkinson vynašiel stroj na vyvrtávanie hlavne pištole, ktorý sa v nasledujúcom roku používal na obrábanie blokov valcov pre parný stroj Watt. V roku 1776 zostrojil presnejšiu valcovú vyvrtávačku. Okolo roku 1880 sa v Nemecku začala výroba horizontálnych vyvrtávačiek s prednými a zadnými stĺpikmi a stolmi. S cieľom prispôsobiť sa spracovaniu mimoriadne veľkých a mimoriadne ťažkých obrobkov bola v 30. rokoch 20. storočia vyvinutá podlahová vyvrtávačka. S nárastom počtu frézovacích prác sa v 50. rokoch objavili frézy na vyvrtávanie podlahy. Na začiatku 20. storočia v dôsledku rozvoja hodinárskeho a prístrojového priemyslu vznikla potreba zariadení s malou chybou rozstupu otvorov a vo Švajčiarsku sa objavili súradnicové vyvrtávačky. Aby sa zlepšila presnosť polohovania vyvrtávačiek, boli široko používané optické čítacie hlavy alebo digitálne zobrazovacie zariadenia. Niektoré vyvrtávačky tiež používajú digitálny riadiaci systém na automatizáciu procesov polohovania súradníc a obrábania.